末世来临，恐怖笼罩整个世界，地球成为丧尸和变异生物的狩猎场。贫穷少年赵天磊意外获得神秘超级系统，当他目睹眼前人间的惨状，以及身边人的逝去，又怎能做到袖手旁观？！且看拥有超级升级和兑换系统的赵天磊，带领人类与怪异对抗，恢复人类文明！

多年前，野心勃勃、一心想统治宇宙的黑暗大帝危害环境、破坏和平，宇宙盟主北斗星王为了阻止他，在经过一番激烈的宇宙大战后，终把黑暗大帝冰封于地球极地冰岩之下，使他与世隔绝。为了防止黑暗大帝破解封印，在冰封黑暗大帝之后，北斗星王在地球高僧的指引下发现了地球六只神兽，用北斗星能量和技术制造了六只神兽金刚，并把他的儿子麒麟王和他的守护精灵小精灵留守在地球上。这六只神兽金刚分别是麒麟金刚、青龙金刚、白虎金刚、玄武金刚、朱雀金刚和鹰龙金刚。只有六位超异能的小孩才能驾驭这六件神兽金刚。

平衡的九重天崩陷为九大天锥降临世界各地，无数人类被吸入其中。九重天的守护神被邪恶力量侵蚀控制，肆虐地球。为解救危机，神兽战队艰难与之抗争，得到希望元神的认可，获得力量，勇闯九重天，经历奇幻冒险和重重考验，凭借坚强意志和内心正义，打破黑暗军团的阴谋，最终修复九重天，拯救了人类和地球。

《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。

九重天危机后，世界又恢复了一派安宁景象。当今社会，手机、电脑等电子设备成为了人们的生活必需品，网络信号覆盖全球。有很多人沉迷其中，忽略现实生活，导致生理、心理疾病，甚至道德败坏。这成为了现代社会的顽疾，也让地球成为了黑暗势力的新目标。病毒机械兽来袭地球，散播黑晶，黑晶像蒲公英一样飘入人们的电子设备屏幕里，吸收能量后吞噬屏幕面前的人，使普通人变成黑士兵，而一些沉迷网络，或有网络恶习的人变成机械兽。

被称为第一废物的吴燃在一次战斗重伤中偶然激活乾坤之宝圣魂骰子系统，获得了奇异古怪的神骰技能，解救了小师叔，打败了女修仙者霓纱，但是没有想到女修仙者霓纱对他有了爱慕之心。并且要把吴燃抓回宗门。女修仙者霓纱联合白龙王，一同进攻地球城池，想要获得乾坤之宝。最终，吴燃打败了霓纱，守护地球城池。

本作为此动画片画下完美句点，同名原著漫画拥有超高人气，销量卖破3,800万册。 　　在漫画原著铃木央创作的剧情中，核心人物是《七大罪》主角梅里奥达斯和妻子伊丽莎白所生的儿子“崔斯坦”。他继承了双亲强大的力量却不知该如何控制，在这过程中他遇见了劲敌兰斯洛特，两人最后协力对抗威胁取他母亲性命的戴斯皮亚斯。 　　本片结合《七大罪》和《周刊少年 Magazine》现正连载的漫画《启示录四骑士》，《七大罪》尚未公开的故事全貌终于揭晓。

青木大介（间岛淳司 配音）是一个个性朴素，面对女性有些还有的普通男子，身为教师的他目前任教于一所小学。不知为何，就是这样一个无比平凡的人，居然被班上有名的问题儿童九重凛（喜多村英梨 配音）看上了，性格奔放泼辣的她当即决定，这辈子非青木老师不嫁。 　　为了追求青木，凛设计了许多作战方案，但在两个损友镜黑（真堂圭 配音）和宇佐美美（门胁舞以 配音）的“帮助”下，这些作战均以失败告终。不仅如此，在学校里，还出现了宝院京子（田中凉子 配音）这一强大的情敌，一时之间凛如临大敌。在打闹之间，本来对凛感到十分头痛的青木竟然逐渐的开始在意起凛的一举一动来，这差距甚大的两人最终能够走到一起吗？

故事发生北宇治高中，黄前久美子（黑泽知叶 配音）刚刚踏入校园，对于未知的高中生活，久美子充满了憧憬。加藤叶月（朝井彩加 配音）是久美子的同级生，在叶月的极力劝说之下，耳根软的久美子在半推半就之下加入了学校的吹奏乐部。曾经，吹奏乐部有着十分辉煌的历史，然而，在换了顾问之后，吹奏乐部渐渐落寞，如今，音乐老师泷升（樱井孝宏 配音）作为新的顾问新鲜赴任，他对重振吹奏乐部，进军全国大会有着极大的信心。 　　个性乐观开朗的川岛绿辉（丰田萌绘 配音）、理智冷静的高坂丽奈（安济知佳 配音）、大姐头田中明日香（寿美菜子 配音），在这些前辈们的陪伴和指导之下，久美子快乐的高中生活就此拉开序幕。